Artikel

Opzetten pan-flavivirus moleculaire diagnostiek en typering door sequencing

Implementatie van pan-flavivirus diagnostiek en Nanopore sequencing van geselecteerde flavirussen.

Dit onderzoek is onderdeel van een groter overstijgend doel, namelijk om in Amsterdam dreigingen van infectieziekten fijnmazig te surveilleren zodat we tijdig iets kunnen zeggen over de introductie, vestiging, ziektelast en/of sterfte aan emerging infections. Tijdig inzicht daarin geeft ons meer inzicht in handelingsperspectief. De uitdaging hierin is om data uit verschillende bronnen (diagnostiek in 1e, 2e lijn en surveillance) te integreren om een zo compleet mogelijk beeld te krijgen en te zorgen dat de data ook tijdig beschikbaar is om landelijk beleid te vormen. Hieraan wordt ook gewerkt in het programma pandemic preparedness en valt buiten de scope van deze aanvraag. Dit onderzoek zal op meerdere vlakken van toegevoegde waarde zijn voor Amsterdam als internationale stad, met veel introducties van nieuwe infecties door reizigers uit endemische gebieden. Ook hebben vele flavivirussen een urbane (humane) transmissie cyclus die op deze manier vroegtijdig gedetecteerd zou kunnen worden (figuur 1). Door de recente detectie van West-Nile virus in Nederland in 2020 in regio Utrecht is het van belang dat er laagdrempelig diagnostische mogelijkheden in de regio Amsterdam voorhanden zijn.

Looptijd: 1-4-22 tot 31-12-2022

Bronvermelding: Wikipedia