FGMA regelt de inzet van onafhankelijke artsen bij onderzoek van slachtoffers van zedendelicten en geweld, bij ambtelijke lijkschouwingen en bij keuringen (in verband met bijzondere bijstand, parkeervergunningen, schuldsanering, huisvesting en leerlingenvervoer). Forensische artsen van FGMA verlenen samen met verpleegkundigen medische zorg aan arrestanten in cellencomplexen van de politie.
Binnen de afdeling is een onderzoeksteam actief die werkt aan diverse projecten binnen de forensische geneeskunde. De thema's van de onderzoeksprojecten lopen uiteen van middelengebruik tot de monitoring van het gebruik van stroomstootwapens en postmortale toxicologie tot aan letsel gerelateerd onderzoek.